| 單 位 | 姓 名 | 成 績 | 分段時間 | 晉 級 | 備 註 |
| 陽明交大 | 3150劉士賢 | 01:12.03 | 50M: 34.06, 100M: 1:12.03 | q01 | |
| 臺北護大 | 3184陳忠仁 | 01:12.17 | 50M: 34.01, 100M: 1:12.16 | q02 | |
| 淡江大學 | 3247陳肇翔 | 01:12.31 | 50M: 33.25, 100M: 1:12.31 | q03 | |
| 臺灣大學 | 3194曾廷綸 | 01:12.69 | 50M: 34.06, 100M: 1:12.69 | q04 | |
| 臺灣體大 | 3222黃唯鑫 | 01:12.97 | 50M: 33.78, 100M: 1:12.97 | q05 | |
| 空軍官校 | 3045劉定紘 | 01:13.09 | 50M: 34.03, 100M: 1:13.09 | q06 | |
| 清華大學 | 3136陳鴻賢 | 01:13.57 | 50M: 35.06, 100M: 1:13.57 | q07 | |
| 高雄科大 | 3128胡思宏 | 01:13.91 | 50M: 34.85, 100M: 1:13.91 | q08 | |
| 清華大學 | 3138吳柏勳 | 01:13.96 | 50M: 32.77, 100M: 1:13.96 | | |
| 高雄科大 | 3125王哲明 | 01:14.06 | 50M: 34.76, 100M: 1:14.06 | | |
| 海洋大學 | 3216周 群 | 01:15.29 | 50M: 34.15, 100M: 1:15.29 | | |
| 成功大學 | 3090林上傑 | 01:15.92 | 50M: 35.51, 100M: 1:15.92 | | |
| 陸軍官校 | 3263朱智陽 | 01:16.10 | 50M: 35.04, 100M: 1:16.10 | | |
| 海洋大學 | 3217江浩宇 | 01:16.51 | 50M: 34.49, 100M: 1:16.51 | | |
| 東華大學 | 3099王維安 | 01:18.28 | 50M: 36.33, 100M: 1:18.28 | | |
| 臺灣師大 | 3207王昱程 | 01:18.63 | 50M: 35.28, 100M: 1:18.63 | | |
| 中山醫大 | 3002張皓翔 | 01:19.26 | 50M: 36.76, 100M: 1:19.26 | | |
| 臺北科大 | 3172李宸宇 | 01:20.34 | 50M: 36.18, 100M: 1:20.34 | | |
| 陽明交大 | 3145侯鈞元 | 01:20.55 | 50M: 37.68, 100M: 1:20.55 | | |
| 中興大學 | 3078孫郁傑 | 01:20.56 | 50M: 34.22, 100M: 1:20.56 | | |
| 嘉義大學 | 3161徐士喆 | 01:22.47 | 50M: 38.26, 100M: 1:22.47 | | |
| 中山大學 | 3058王煥瑞 | 01:23.03 | 50M: 38.48, 100M: 1:23.03 | | |
| 政治大學 | 3121施凱斌 | 01:23.70 | 50M: 37.76, 100M: 1:23.70 | | |
| 文化大學 | 3013林輝亮 | 01:23.71 | 50M: 37.46, 100M: 1:23.71 | | |
| 臺北醫大 | 3276陸志剛 | 01:23.79 | 50M: 37.38, 100M: 1:23.79 | | |
| 東吳大學 | 3031楊鈞亦 | 01:24.01 | 50M: 38.88, 100M: 1:24.01 | | |
| 臺灣師大 | 3204朱 沁 | 01:24.24 | 50M: 36.93, 100M: 1:24.24 | | |
| 中央大學 | 3069高健智 | 01:24.33 | 50M: 39.30, 100M: 1:24.33 | | |
| 臺北大學 | 3164黃家棋 | 01:24.70 | 50M: 39.04, 100M: 1:24.70 | | |
| 臺北大學 | 3163林冠廷 | 01:24.73 | 50M: 41.48, 100M: 1:24.73 | | |
| 國防大學 | 3235邱士祥 | 01:25.49 | 50M: 40.71, 100M: 1:25.49 | | |
| 靜宜大學 | 3292卓傑元 | 01:25.74 | 50M: 39.77, 100M: 1:25.74 | | |
| 中央大學 | 3070李岳家 | 01:26.35 | 50M: 39.18, 100M: 1:26.35 | | |
| 東海大學 | 3038簡宏熹 | 01:26.39 | 50M: 40.57, 100M: 1:26.39 | | |
| 中山大學 | 3057盧岳洋 | 01:27.28 | 50M: 40.00, 100M: 1:27.28 | | |
| 東華大學 | 3100呂學威 | 01:27.58 | 50M: 42.23, 100M: 1:27.58 | | |
| 淡江大學 | 3248周庭安 | | 50M: 35.59, 100M: 1:16.10 | | 犯規 |
| 臺灣大學 | 3185林上智 | | 50M: 33.51, 100M: 1:12.50 | | 犯規 |
| 東海大學 | 3040陳孝齊 | | 50M: 54.41, | | 犯規 |
| 逢甲大學 | 3254曾昱誠 | | 50M: 41.82, 100M: 1:30.72 | | 逾時 |
| 成功大學 | 3091鐘大宇 | | 50M: 44.37, 100M: 1:39.42 | | 逾時 |
| 文化大學 | 3015許宸瑋 | | 50M: 47.76, | | 逾時 |
| 中原大學 | 3011劉兆軒 | | 50M: 42.14, | | 逾時 |
| 臺北科大 | 3181童仕翰 | | 50M: 42.29, | | 逾時 |
| 政治大學 | 3120羅紹耘 | | 50M: 39.46, | | 逾時 |
| 中興大學 | 3077王奕鈞 | | | | 請假 |
| 臺北醫大 | 3277李瀚恩 | | | | 請假 |
| 靜宜大學 | 3293蔡秉翰 | | | | 請假 |