| 單 位 | 姓 名 | 成 績 | 分段時間 | 晉 級 | 備 註 |
| 中央大學 | 3066孫秉蔚 | 00:59.07 | 50M: 27.35, 100M: 59.07 | q01 | |
| 雲林科大 | 3158鄭宇宸 | 01:01.24 | 50M: 27.95, 100M: 1:01.24 | q02 | |
| 臺灣大學 | 3187方鈺學 | 01:02.81 | 50M: 28.67, 100M: 1:02.81 | q03 | |
| 空軍官校 | 3047宋增麟 | 01:03.22 | 50M: 29.46, 100M: 1:03.22 | q04 | |
| 臺灣大學 | 3189陳柏語 | 01:03.53 | 50M: 28.76, 100M: 1:03.53 | q05 | |
| 高雄科大 | 3123黃嘉笙 | 01:04.35 | 50M: 30.29, 100M: 1:04.35 | q06 | |
| 政治大學 | 3116吳岱融 | 01:04.92 | 50M: 29.95, 100M: 1:04.92 | q07 | |
| 高雄科大 | 3130蘇彥文 | 01:05.00 | 50M: 29.96, 100M: 1:05.00 | q08 | |
| 臺灣體大 | 3221黃丞緯 | 01:05.15 | 50M: 28.32, 100M: 1:05.15 | | |
| 國立體大 | 3230陳秉献 | 01:05.51 | 50M: 29.86, 100M: 1:05.51 | | |
| 輔仁大學 | 3287張韶琦 | 01:05.78 | 50M: 30.46, 100M: 1:05.77 | | |
| 臺灣師大 | 3210簡榮星 | 01:06.57 | 50M: 30.62, 100M: 1:06.57 | | |
| 中山大學 | 3053柯泓邦 | 01:06.92 | 50M: 27.51, 100M: 1:06.92 | | |
| 陽明交大 | 3154杜彥呈 | 01:06.93 | 50M: 28.71, 100M: 1:06.93 | | |
| 中央大學 | 3063陳俊安 | 01:07.09 | 50M: 31.62, 100M: 1:07.09 | | |
| 臺北大學 | 3169徐肇谷 | 01:07.28 | 50M: 30.76, 100M: 1:07.28 | | |
| 國防醫學院 | 3238鄭尚昀 | 01:07.87 | 50M: 30.48, 100M: 1:07.87 | | |
| 成功大學 | 3095黃柏睿 | 01:07.98 | 50M: 30.97, 100M: 1:07.98 | | |
| 陸軍專校 | 3266謝政群 | 01:08.80 | 50M: 29.20, 100M: 1:08.79 | | |
| 嘉義大學 | 3162鄭力中 | 01:08.86 | 50M: 30.72, 100M: 1:08.86 | | |
| 金門大學 | 3112蔡秉翰 | 01:09.28 | 50M: 30.57, 100M: 1:09.28 | | |
| 文化大學 | 3014李禕耘 | 01:11.18 | 50M: 31.52, 100M: 1:11.18 | | |
| 成功大學 | 3096林宗承 | 01:11.49 | 50M: 33.01, 100M: 1:11.49 | | |
| 臺灣師大 | 3202周煜甯 | 01:12.56 | 50M: 33.04, 100M: 1:12.56 | | |
| 海軍官校 | 3051林柏宏 | 01:13.54 | 50M: 32.99, 100M: 1:13.54 | | |
| 淡江大學 | 3250張簡晨昀 | 01:14.55 | 50M: 31.27, | | |
| 政治大學 | 3122陳宇澤 | 01:17.26 | 50M: 34.64, 100M: 1:17.26 | | |
| 臺北科大 | 3182簡言宇 | 01:17.99 | 50M: 32.84, 100M: 1:17.99 | | |
| 輔英科大 | 3290張庭睿 | | | | 棄權 |
| 臺北醫大 | 3280莊育博 | | 50M: 39.01, | | 逾時 |
| 清華大學 | 3141吳念勳 | | 50M: 38.43, 100M: 1:27.98 | | 逾時 |
| 清華大學 | 3142王承隆 | | 50M: 36.11, 100M: 1:19.27 | | 逾時 |
| 陽明交大 | 3147韓在元 | | 50M: 35.74, 100M: 1:22.03 | | 逾時 |
| 東華大學 | 3106LINARES OTOYA PAULO | | 50M: 40.21, | | 逾時 |
| 東華大學 | 3108郭鎧瑞 | | 50M: 41.16, | | 逾時 |
| 臺北大學 | 3171劉若安 | | 50M: 34.99, 100M: 1:19.52 | | 逾時 |
| 淡江大學 | 3246吳靖沅 | | 50M: 45.35, | | 逾時 |
| 國防大學 | 3231李柏儒 | | 50M: 35.91, | | 逾時 |
| 臺北科大 | 3178湯世明 | | | | 請假 |
| 臺北醫大 | 3272林奕辰 | | | | 請假 |
| 靜宜大學 | 3296陳凱暄 | | | | 請假 |
| 聯合大學 | 3228謝秉軒 | | | | 請假 |